焦山行宫是清乾隆皇帝南巡时下榻比较多的地方。据《焦山志》载，乾隆皇帝十分喜爱焦山的山水。他六下江南八上焦山五次入住焦山，并留下大量的诗词楹联匾额。据史书上记载，焦山行宫于乾隆二十六年（1761年）建成，有焦山行宫、东行宫、上行宫三个部分，因战火先后被毁，现焦山行宫是在自然庵和五圣庵旧址上改建而成，为典型的江南小庭院，有船亭、黄叶楼、梅花楼、画禅山房、文殊阁、梦焦山仙馆、观澜阁等建筑，空间布局独特，层次富于变化，呈典型的江南民居式建筑群。植物配置均采用传统的配置艺术手法，以松、竹、梅构成"岁寒三友"景观，以桂花、玉兰、海棠、迎春形成"金玉满堂"景观，面积不过二千平方米，却有竹园、桂林，布置得十分紧凑、典雅。